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Actualités

11 février 2020

Le Professeur Pierre Hainaut a été nommé président du Cancéropôle Lyon Auvergne-Rhône-Alpes (CLARA) lors du Conseil d’Orientation et de Surveillance (COS) qui s’est tenu en présence de Monsieur de Préfet de la région Auvergne-Rhône-Alpes, Pascal Mailhos, mercredi 5 février 2020. 

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16 décembre 2019

Les polluants atmosphériques pourraient-ils avoir un impact sur le bon déroulement du cycle menstruel ? C’est la question sur laquelle s’est penchée l'équipe de Rémy SLAMA. Les dosages hormonaux réalisés dans les urines de 184 femmes durant un cycle menstruel complet ont été mis en relation avec les niveaux de pollution auxquels ces femmes étaient exposées durant les 30 jours précédant ce cycle. Les chercheurs ont observé une association entre la concentration de particules fines dans l’air et la durée de la phase folliculaire du cycle (la phase précédant l’ovulation), cette dernière tendant à augmenter avec les niveaux de pollution. Ces résultats originaux publiés dans Environmental Pollution incitent à mettre en place des études à plus grande échelle afin de confirmer ces résultats.

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7 novembre 2019

Des chercheurs de l’équipe du Dr. Mohamed-Ali HAKIMI (Institute for Advanced Biosciences - Inserm U 1209 / CNRS UMR 5309 / UGA) et de l’équipe du Dr. Fabrice LAURENT (INRA) viennent de découvrir un nouveau candidat-médicament pour contrôler la Cryptosporidiose, une maladie intestinale grave chez l’enfant et les patients immunodéprimés. Ces travaux sont publiés dans Science Translational Medicine.

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21 juillet 2019

La compréhension des bases métaboliques de l'embryogenèse est l'un des enjeux de la biologie du développement. La crête neurale (CN) est une structure propre aux vertébrés constituée de cellules multipotentes présentes de manière transitoire dans la région dorso-latérale du tube neural. Après migration dans l’embryon, ces cellules contribuent à la formation de nombreux organes. Des chercheurs de l'IAB ont montré que le suppresseur de tumeur Lkb1 est un régulateur essentiel des voies métaboliques requises lors de la différenciation de plusieurs dérivés de la CN. Ces travaux sont publiés dans la revue Science Advances.

12 juin 2019

Un travail conjoint de chercheurs de l'IAB (Inserm / CNRS / UGA), d’Atmo AuRA, du laboratoire GAEL et de l' INRA, Bourgogne Franche-Comté Univ., Dijon donne un ordre de grandeur des coûts de la pollution en milieu urbain et des diminutions de la pollution à atteindre. L’article a été publié dans Environnemental international.

10 juin 2019

Les fibres amyloïdes, des agrégats protéiques qui s’accumulent dans le cerveau sous forme de plaques dans certaines maladies neurodégénératives, peuvent être observées par imagerie en proche infrarouge. Cette découverte d'équipes de l'IAB, du CEA, de Grenoble INP, du Synchrotron Grenoble, de l'Université de Cergy-Pontoise et de l’école de médecine de Genève a été démontrée en réalisant une observation inédite chez la souris, sans aucun marquage ou agent de contraste.

 

Les dernières publications

> Équipe ALBIGES-RIZO (Dynamique de l'adhésion cellulaire et differentiation)

Cellular tension encodes local Src-dependent differential β1 and β3 integrin mobility. De Mets R1, Wang I1, Balland M1, Oddou C2, Moreau P1, Fourcade B1, Albiges-Rizo C2, Delon A1, Destaing O2. Mol Biol Cell. 2018 Nov 21:mbcE18040253. doi: 10.1091/mbc.E18-04-0253. [Epub ahead of print]

ERRα promotes breast cancer cell dissemination to bone by increasing RANK expression in primary breast tumors. Vargas G, Bouchet M, Bouazza L, Reboul P, Boyault C, Gervais M, Kan C, Benetollo C, Brevet M, Croset M, Mazel M, Cayrefourcq L, Geraci S, Vacher S, Pantano F, Filipits M, Driouch K, Bieche I, Gnant M, Jacot W, Aubin JE, Duterque-Coquillaud M, Alix-Panabières C, Clézardin P, Bonnelye E. Oncogene. 2018 Nov 26.

Cellular tension encodes local Src-dependent differential β1 and β3 integrin mobility. De Mets R, Wang I, Balland M, Oddou C, Moreau P, Fourcade B, Albiges-Rizo C, Delon A, Destaing O. Mol Biol Cell. 2018 Nov 21:mbcE18040253. doi: 10.1091/mbc.E18-04-0253

Interrogating the ccm-3 Gene Network. Lant B, Pal S, Chapman EM, Yu B, Witvliet D, Choi S, Zhao L, Albiges-Rizo C, Faurobert E, Derry WB. Cell Rep. 2018 Sep 11;24(11):2857-2868.e4. doi: 10.1016/j.celrep.2018.08.039

Piezo2 channel regulates RhoA and actin cytoskeleton to promote cell mechanobiological responses. Pardo-Pastor C, Rubio-Moscardo F, Vogel-González M, Serra SA, Afthinos A, Mrkonjic S, Destaing O, Abenza JF, Fernández-Fernández JM, Trepat X, Albiges-Rizo C, Konstantopoulos K, Valverde MA. Proc Natl Acad Sci U S A

> Équipe ARNOULT / RAY (Genetique, Epigenetique et Thérapies de l'infertilité)

Bi-allelic Mutations in ARMC2 Lead to Severe Astheno-Teratozoospermia Due to Sperm Flagellum Malformations in Humans and Mice. Coutton C, Martinez G, Kherraf ZE, Amiri-Yekta A, Boguenet M, Saut A, He X, Zhang F, Cristou-Kent M, Escoffier J, Bidart M, Satre V, Conne B, Fourati Ben Mustapha S, Halouani L, Marrakchi O, Makni M, Latrous H, Kharouf M, Pernet-Gallay K, Bonhivers M, Hennebicq S, Rives N, Dulioust E, Touré A, Gourabi H, Cao Y, Zouari R, Hosseini SH, Nef S, Thierry-Mieg N, Arnoult C, Ray PF. Am J Hum Genet. 2019 104, 331–340, February 7, doi: 10.1016/j.ajhg.2018.12.013.

Loss of the deglutamylase CCP5 perturbs multiple steps of spermatogenesis and leads to male infertility. Giordano T, Gadadhar S, Bodakuntla S, Straub J, Leboucher S, Martinez G, Chemlali W, Bosc C, Andrieux A, Bieche I, Arnoult C, Geimer S, Janke C. J Cell Sci. 2019 Jan 11. pii: jcs.226951. doi: 10.1242/jcs.226951.

The eggstraordinary story of how life begins. Parrington J, Arnoult C, Fissore RA. Mol Reprod Dev. 2019 Jan;86(1):4-19. doi: 10.1002/mrd.23083. Epub 2018 Nov 30. Review.

Oocyte maturation failure: an essential role for the protein PATL2 in human oogenesis Christou-Kent M, Ray PF, Arnoult C. Med Sci (Paris). 2018 Dec;34(12):1042-1045. doi: 10.1051/medsci/2018287. Epub 2019 Jan 9. French. No abstract available.

A Homozygous Ancestral SVA-Insertion-Mediated Deletion in WDR66 Induces Multiple Morphological Abnormalities of the Sperm Flagellum and Male Infertility. Kherraf ZE, Amiri-Yekta A, Dacheux D, Karaouzène T, Coutton C, Christou-Kent M, Martinez G, Landrein N, Le Tanno P, Fourati Ben Mustapha S, Halouani L, Marrakchi O, Makni M, Latrous H, Kharouf M, Pernet-Gallay K, Gourabi H, Robinson DR, Crouzy S, Blum M, Thierry-Mieg N, Touré A, Zouari R, Arnoult C, Bonhivers M, Ray PF. Am J Hum Genet. 2018 Sep 6;103(3):400-412. doi: 10.1016/j.ajhg.2018.07.014. Epub 2018 Aug 16.

Whole-exome sequencing identifies mutations in FSIP2 as a recurrent cause of multiple morphological abnormalities of the sperm flagella.Martinez G, Kherraf ZE, Zouari R, Fourati Ben Mustapha S, Saut A, Pernet-Gallay K, Bertrand A, Bidart M, Hograindleur JP, Amiri-Yekta A, Kharouf M, Karaouzène T, Thierry-Mieg N, Dacheux-Deschamps D, Satre V, Bonhivers M, Touré A, Arnoult C, Ray PF, Coutton C. Hum Reprod. 2018 Oct 1;33(10):1973-1984. doi: 10.1093/humrep/dey264.

> Equipe BEDNAR (Chromatine & Epigénétique)

Semi-Automates fact-checking of nucleotide sequence reagents in biomedical research publications: the seek & blastn tool Cyril Labbé, Natalie Grima, Thierry Gautier, Bertrand Favier, Jennifer A. Byrne Plos OnePONE-D-18-20625R

> Équipe COLL (Thérapie ciblée, Diagnostic précoce et Imagerie du cancer)

Ultraviolet–visible–near-infrared optical properties of amyloid fibrils shed light on amyloidogenesis. Pansieri J, Josserand V, Lee S-J, Rongier A, Imbert D, Sallanon MM, Kövari E, Dane TG, Vendrely C, Chaix-Pluchery O, Guidetti M, Vollaire J, Fertin A, Usson Y, Rannou P, Coll J-L, Marquette C, Forge V (2019) Nature Photonics

Photoacoustic imaging as an innovative technique for the exploration of Blue Rubber Bleb Nevus. Lavaud J, Coll JL, Cracowski JL, Blaise S, Josserand V.Br J Dermatol. 2019 Feb 11. doi: 10.1111/bjd.17765. [Epub ahead of print]

Équipe EYMIN (Épissage alternatif des ARNs, Signalisation cellulaire et Réponse aux thérapies)

VEGF165b, a splice variant of VEGF-A, promotes lung tumor progression and escape from anti-angiogenic therapies through a β1 integrin/VEGFR autocrine loop. Boudria A, Abou Faycal C, Jia T, Gout S, Keramidas M, Didier C, Lemaitre N, Manet S, Coll J.L, Toffart A.C, Moro-Sibilot D, Albiges-Rizo C, Josserand V, Faurobert E, Brambilla C, Brambilla E, Gazzeri S & Eymin B (2019) Oncogene, 38(7):1050-1066

> Équipe GUILLUY (Mécanotransduction et Fonctions nucléaires)

Nuclear envelope deformation controls cell cycle progression in response to mechanical force. Aureille J, Buffière-Ribot V, Harvey BE, Boyault C, Pernet L, Andersen T, Bacola G, Balland M, Fraboulet S, Van Landeghem L and Guilluy C. (2019)  EMBO Reports

> Équipe KHOCHBIN (Épigénétique et Signalisation cellulaire)

Transcription factor dimerization activates the p300 acetyltransferase Esther Ortega, Srinivasan Rengachari, Ziad Ibrahim, Naghmeh Hoghoughi, Jonathan Gaucher Alex S. Holehouse, Saadi Khochbin & Daniel Panne NatureOct. 2018 https://doi.org/10.1038/s41586-018-0621-1

Nut Directs p300-Dependent, Genome-Wide H4 Hyperacetylation in Male Germ Cells. Shiota H, Barral S, Buchou T, Tan M, Couté Y, Charbonnier G, Reynoird N, Boussouar F, Gérard M, Zhu M, Bargier L, Puthier D, Chuffart F, Bourova-Flin E, Picaud S, Filippakopoulos P, Goudarzi A, Ibrahim Z, Panne D, Rousseaux S, Zhao Y, Khochbin S. Cell Rep. 2018 Sep 25;24(13):3477-3487.e6. doi: 10.1016/j.celrep.2018.08.069.

Équipe HAINAUT (Pathologie moléculaire des cancers et biomarqueurs)

LKB1 specifies neural crest cell lineages through pyruvate-alanine cycling. Radu A*, Torch S*, Fauvelle F, Pernet-Gallay K, Blervaque R, Lucas A, Delmas V, Schlattner U, Tricaud N, Lafenechère L, Hainaut P, Tricaud N, Pingault V, Bondurand N, Bardeesy N, Larue L, Thibert C and Billaud M. 2019 Science Advances, 5:5106

Variable population prevalence estimates of germline TP53 variants: A gnomAD-based analysis. deAndrade KC1,2, Frone MN, Wegman-Ostrosky T, Khincha PP, Kim J, Amadou A, Santiago KM, Fortes FP, Lemonnier N, Mirabello L, Stewart DR, Hainaut P, Kowalski LP, Savage SA, Achatz MI Hum Mutat. 2019 Jan;40(1):97-105. doi: 10.1002/humu.23673. Epub 2018 Nov 19.

> Équipe HAKIMI (Interactions Hôte-Pathogène & Immunité des infections)

The Toxoplasma effector TEEGR promotes parasite persistence by modulating NF-kB signalling via EZH2. Braun L, Brenier-Pinchart MP, Hammoudi PM, Cannella D, Kieffer-Jaquinod S, Vollaire J, Josserand V, Touquet B, Coute Y, Tardieux I, Bougdour A, and Hakimi MA (2019) Nature Microbiology. doi: 10.1038/s41564-019-0431-8.

Characterization of a Toxoplasma effector uncovers an alternative GSK3/β-catenin-regulatory pathway of inflammation. He H, Brenier-Pinchart MP, Braun L, Kraut A,Touquet B,Couté Y, Tardieux I, Hakimi MA& Bougdour A (2018) Elife. pii: e39887.

Équipe LAFANECHERE (Régulation et pharmacologie du cytosquelette)

Specific targeting of plant and apicomplexa parasite tubulin through differential screening using in silico and assay-based approaches.Soleilhac E., Brillet-Guéguen L., Roussel V., Prudent R., Touquet B., Dass S., Aci-Sèche S., Kasam V., Barette C., Imberty A, Breton V., Vantard M., Horvath D., Botté C., Tardieux I., Roy S., Maréchal E. and Lafanechère L. (201 Int. J. Mol. Sci. 19(10).

Vasohibins/SVBP are tubulin carboxypeptidases (TCPs) that regulate neuron differentiation. Aillaud C., Bosc C., Peris L., Bosson A., Heemeryck P., Van Dijk J., Le Friec J., Boulan B., Vossier F., Sanman L.E., Syed S., Amara N., Couté Y., Lafanechère L., Denarier E., Delphin C., Pelletier L., Humbert S., Bogyo M., Andrieux A., Rogowski K. and Moutin M.J. (2017) Science358:1448-1453.

Équipe MILLET (Mécanobiologie, Immunité et Cancer)

3D type I collagen environment leads up to a reassessment of the classification of human macrophage polarizations. Court M, Malier M, Millet A*. (2019) Biomaterials. Jul;208:98-109.

Proteomic Analysis of Human Macrophage Polarization Under a Low Oxygen Environment. Court, M., Malier, M., Millet, A.  J. Vis. Exp. (143), e58727, doi:10.3791/58727 (2019).

> Équipe SLAMA (Épidémiologie Environnementale appliquée à la Reproduction et la Santé Respiratoire)

Early-life exposome and lung function in children in Europe: An analysis of data from the longitudinal, population-based Helix cohort Agier L, Basagana X, … Slama R, Vrijheid M, Siroux V.[with an invited commentary]. Lancet Planet Health. E81-e92. 2019

In-utero and childhood chemical exposome in six European mother-child cohorts. Haug LS, Sakhi AK, Cequier E, Casas M, Maitre L, Basagana X, Andrusaityte S, Chalkiadaki G, Chatzi L, Coen M, de Bont J, Dedele A, Ferrand J, Grazuleviciene R, Gonzalez JR, Gutzkow KB, Keun H, McEachan R, Meltzer HM, Petraviciene I, Robinson O, Saulnier PJ, Slama R, Sunyer J, Urquiza J, Vafeiadi M, Wright J, Vrijheid M, Thomsen C. Environ Int. 2018 Dec;121(Pt 1):751-763. doi: 10.1016/j.envint.2018.09.056. Epub 2018 Oct 14.

Variability of urinary concentrations of non-persistent chemicals in pregnant women and school-aged children. Casas M, Basagaña X, Sakhi AK, Haug LS, Philippat C, Granum B, Manzano-Salgado CB, Brochot C, Zeman F, de Bont J, Andrusaityte S, Chatzi L, Donaire-Gonzalez D, Giorgis-Allemand L, Gonzalez JR, Gracia-Lavedan E, Grazuleviciene R, Kampouri M, Lyon-Caen S, Pañella P, Petraviciene I, Robinson O, Urquiza J, Vafeiadi M, Vernet C, Waiblinger D, Wright J, Thomsen C, Slama R, Vrijheid M. Environ Int. 2018 Dec;121(Pt 1):561-573. doi: 10.1016/j.envint.2018.09.046. Epub 2018 Oct 6.

Analysis of multicentre epidemiological studies: contrasting fixed or random effects modelling and meta-analysis. Basagaña X1,2,3, Pedersen M4,5, Barrera-Gómez J1,2,3, Gehring U4, Giorgis-Allemand L5, Hoek G4, Stafoggia M6,7, Nieuwenhuijsen MJ1,2,3, Brunekreef B4, Slama R5; ESCAPE Birth Outcomes working group. Int J Epidemiol. 2018 Aug 1;47(4):1343-1354. doi: 10.1093/ije/dyy117.

Pregnancy exposure to atmospheric pollution and meteorological conditions and placental DNA methylation Abraham E, Rousseaux S Agier L, Giorgis-Allemand L, Tost J, Galineau J, Hulin A, Siroux V, Vaiman D, Charles MA, Heude B, Forhan A, Schwartz J, Chuffart F, Bourova-Flin E, Khochbin S, Slama R, Lepeule J Environ Int. 2018 Jun 19. pii: S0160-4120(17)32043-3. doi: 10.1016/j.envint.2018.05.007. [Epub ahead of print]

> Équipe TARDIEUX (Dynamiques membranaires dans les interactions parasites-hôtes)

Intracellular protozoan parasites: living probes of the host cell surface molecular repertoire. Pavlou G, Milon G & Tardieux I (2019) Current Opinion in Microbiology, Jul 23;52:116-123. doi: 10.1016/j.mib.2019.06.007. 

Toxoplasma parasite twisting motion mechanically induces host cell membrane fission to complete invasion within a protective vacuole. Georgios Pavlou, Mateusz Biesaga, Bastien Touquet, Vanessa Lagal, Martial Balland, Alexandre Dufour, Mohamed-ali Hakimi et Isabelle Tardieux. Cell Host & Microbes, juin 2018. DOI : 10.1016/j.chom.2018.06.003

 

 

 

 

Evénements

 

 

 

 

 

Forum de la recherche en cancérologie, 25-26 mars 2020, Lyon

Informations et inscriptions

Félicitations !

Féliciations à Rémy SLAMA pour son prix de l'International Society of Environemental Epidemiology récompensant ses travaux de recherche

Voir le blog de Rémy SLAMA

Découvrir les travaux de son équipe

 

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Les séminaires

 

REJOIGNEZ-NOUS POUR LES SEMINAIRES des MARDIS de l'IAB ! (11 heures, amphithéâtre)

> 18 février 2020 : Frédéric Thomas, IRD, Paris

> 3 mars 2020 : Hans Van OosterwyckKU Leuven, Belgium

> 10 mars 2020 : Géraldine Le DucNH TherAguix SA, Meylan, France

> 17 mars 2020 : Fabrice Laurent, INRA, Tours, France

> 24 mars 2020 : Steven Thomas, University of Birmingham, UK

> 7 avril 2020 : Antonio Barragan, Stockholm University, Sweden

> 14 avril 2020 : Sabrina Fritah, Luxembourg Institute of Health, Luxembourg

> 5 mai 2020 : Pierre Antoine Defossez, University Paris Diderot, France